學校沿革
台塑企業創辦人王永慶及王永在昆仲為追念其尊翁王長庚先生而創辦長庚紀念醫院之後，感於台灣醫護人員的不足，並為培育優秀醫療人才，提升國內醫療水準，於1987年4月創設長庚醫學院。
其後為配合國家經濟發展需要，本校陸續增設工程及管理學類之系所，以提供完整的教學資源，培育優秀醫學、工程及管理人才。發展期間於1993年更改校名為「長庚醫學暨工程學院」，至1997年8月奉教育部核准正式改制為「長庚大學」。
重大紀事
1986.10
第一屆董事會成立，創辦人王永慶先生擔任董事長。
1987.01
本院醫學大樓正式開工興建。
1987.04
教育部正式核定本校立案，並核准設立學士後醫學系、護理學系及醫事技術學系。
1987.09
創校暨76學年度開學典禮。
1990.01
醫學大樓落成啟用。
1992.01
教育部首度公佈私立大學辦學成績單，在20所受審學校中，本校因教學環境佳、財務狀況佳和中程發展計畫佳而獲得最高積分。
1992.06
第一屆畢業典禮。
1992.07
教育部同意本院與長庚紀念醫院實施建教合作。
1992.11
成立長庚大學籌備處。
1992.11
教育部核准本校改名為「長庚醫學暨工程學院」，自1993年8月起生效。
1993.03
教育部核准本校82學年度增設醫管、電機、機械、化工等工程及管理類學系。
1997.07
教育部核准本校改制為「長庚大學」，自1997年8月起生效。
1998.03
全國私立大學校院中程校務發展計畫審查，本校獲獎補助金額為私立大學校院第一。
2001.04
教育部私立大學校院中程校務發展計畫審查，本校表現傑出。在醫學類院校之「教學與輔導」、「研究」、「推廣教育」、「行政運作」、「會計行政」、「計劃與執行」等評核指標中均名列前矛、表現優異。
2002.06
教育部全國私立大學校院校務發展計畫審查結果，本校再度蟬聯教育部評審為醫學類辦學最優學校，所獲獎助經費仍維持私立大學中最高。
2003.07
教育部全國私立大學校院校務發展計畫審查結果，本校仍續名列前矛。在醫學類院校之「校務發展計畫」、「教學與輔導」、「研究」、「推廣服務」、「一般行政」、「資源投入」等評核項目中均列為較優學校。
2003.10
教育部公佈全國大學和技職校院SCI、SSCI、EI論文發表數評比，本校名列全國第四名，以專任教師平均發表數計算則排名全國第二。
2004.08
教育部92學年度私立大學校院校務發展計畫審查結果，本校獲獎補助款經費148,409仟元，以佔教育部總經費比率計算，與去年相近。另在所歸類之醫學類學校中，本校在「校務發展計畫」、「教學與輔導」、「研究」、「一般行政」、「會計行政」等評核項目中獲評為較優學校。
2005.03
本校2003年教師研究論文發表整體表現全國排名第四（次於台大、交大、成大），教師發表論文平均數全國排名第二（僅次於陽明）。
2005.08
全國公私立大學「校務評鑑」結果，本校在代表三個學院之三個類組均獲評為較優學校；在校務評核項目中，亦在「教學資源」、「國際化程度」、「訓輔（學生事務）」、「通識教育」等四項獲評為較優學校。
2005.10
教育部所推動之五年五百億「邁向頂尖大學計畫」，本校穫選為全國12所經費補助重點學校之一。
2007.01
王永慶董事長辭職，經補選由楊定一博士繼任董事長。
2007.04
舉辦創校20週年校慶活動。
2007.10
教育部公佈96年度私立大學校院整體發展獎助及補助經費核撥款，本校獲得1.52億元，在所有學校中居冠。
2008.02
教育部推動「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」，公布第二梯次（97-99年）審議結果，本校再榮獲為全國11所重點發展大學之一，亦為唯一入選的私立大學。
2008.08
上海交大每年會針對各校「學術表現」，公布世界大學排名，本校今年首度進入世界大學排名前五百名。
2008.10
本校創辦人王永慶先生於美國時間10月15日凌晨安祥辭世，創辦人之靈堂設於本校活動中心體育館。
2009.08
高等教育評鑑中心所發佈之「2009世界大學科研論文質量評比」，本校在「不分領域」方面首次於本項評比中入榜前五百名內，為國內惟一之私立大學，本校入榜之排名為479名。另在「分領域」之評比方面，本校仍屬精於「臨床醫學」之學校，目前在該領域之排名為249名。
2010.08
本校續榮獲2010上海交通大學世界大學排名前500名，仍為國內進入500大之唯一私立大學，本年度排名為406名。
2010.10
2001年諾貝爾醫學獎得主Hartwell教授及中央研究院院士黃秉乾教授99學年度起應聘為本校特聘講座教授。
2011.12
高等教育評鑑中心公佈100年度上半年大學校務評鑑之評鑑結果，本校於五個評鑑項目全數「通過」。
2012.08
本校榮獲2012上海交通大學世界大學排名第390名，首度進入前400大，並為國內進入前400大之唯一私立大學。
2012.12
「2012世界大學科研論文質量評比」本校排名晉升至495名；另在「臨床醫學領域排名」方面，本校亦續排名於世界前300名內，為國內進入該領域之前三名學校。
2013.04
本校「教學單位自辦外部評鑑辦法」獲教育部認可並公布實施。
2013.08
本校榮獲2013上海交通大學世界大學學術排名第387名,仍為國內進入前400大之唯一私立大學。
2014.08
本校連續7年進入上海交通大學世界大學學術排名前500大，僅次於台、清、成、交4所國立大學。
2015.01
本校「自我評鑑結果報告書」獲教育部認定，有效期限至2020年止。
2015.08
本校連續8年進入上海交通大學世界大學學術排名前500大。
2016.08
本校連續9年進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前500大，並大幅進步至第300-400名區間。
2017.08
本校連續10年進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前500大，並連續2年名列400名內。
2018.11
董事會經改選後由王文淵先生擔任第11屆董事長。
2019.08
本校連續12年進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前600大。
2020.08
本校連續13年進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前600大。
2021.08
本校13年進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前500大(連續14年入榜前600大)。
2022.08
本校入榜上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前500大(連續15年入榜前600大)。
2023.08
本校出版2023年永續報告書，榮獲第16屆TCSA台灣企業永續獎「白金獎」。
2024.08
本校進入上海軟科（ARWU）世界大學學術排名前600大。
歷任校長:
| 任別 | 校長 | 任期 | 備註 |
| 第1任 | 吳德朗教授 | 1987.05-1997.07 | 1987年創立長庚醫學院 1993年改名長庚醫學暨工程學院 |
| 第1任 | 張昭雄教授 | 1997.08-1999.11 | 1997年改制長庚大學 |
| 第2任 | 吳德朗教授 | 1999.12-2000.08 | 代理校長 |
| 第4任 | 郭南宏教授 | 2000.09-2003.08 |
|
| 第5任 | 包家駒教授 | 2003.09-2021.08 |
|
| 第6任 | 湯明哲教授 | 2021.09-迄今 |
|
沿革：各學院現有系所及設立年度
| 學院別 | 系所名稱 | 學士 | 學士後 | 碩士 | 博士 |
| 醫學院 | 醫學系 | 1989 |
1987 (已停招) |
|
|
| 護理學系 | 1989 | 2016 | 1992 | 2018 | |
| 醫學生物技術暨檢驗學系 | 1989 |
|
2002 |
|
|
| 醫學影像暨放射科學系 | 1996 |
|
2006 | 2015 | |
| 物理治療學系 | 1994 |
|
2002 | 2009 | |
| 職能治療學系 | 1994 |
|
2002 |
|
|
| 中醫學系 | 1998 |
|
2000 |
|
|
| 呼吸治療學系 | 1999 |
|
|
|
|
| 生物醫學系 | 2003 |
|
2019 |
|
|
| 生物醫學研究所 |
|
|
1993 | 1997 | |
| 臨床醫學研究所 |
|
|
1997 | 1990 | |
| 顱顏口腔醫學研究所 |
|
|
2002 |
|
|
| 早期療育研究所 |
|
|
2007 |
|
|
| 醫學科學學位學程 | 2020 |
|
|
|
|
| 新興病毒分子醫學國際學位學程 |
|
|
2013 |
|
|
| 健康暨長期照護產業學位學程 |
|
|
2015 |
|
|
| 生物科技產業學位學程 |
|
|
2015 | 2018 | |
| 顯微手術國際學位學程 |
|
|
2015 |
|
|
| 免疫轉譯醫學研究所 |
|
|
2025 |
|
|
| 工學院 | 電機工程學系 | 1993 |
|
1996 | 1998 |
| 機械工程學系 | 1993 |
|
1996 | 2001 | |
| 化工與材料工程學系 | 1993 |
|
1996 | 1999 | |
| 電子工程學系 | 1997 |
|
1999 | 2001 | |
| 資訊工程學系 | 2003 |
|
2001 | 2019 | |
| 生物醫學工程學系 | 2022 |
|
2018 | 2019 | |
| 光電工程研究所 |
|
|
2002 |
|
|
| 奈米工程及設計學位學程 |
|
|
2018 |
|
|
| 生物醫學工程學位學程 |
|
|
|
2012 (已停招) |
|
| 管理學院 | 醫務管理學系 | 1993 |
|
1995 |
|
| 工商管理學系 | 1994 |
|
1995 |
|
|
| 工業設計學系 | 1994 |
|
2001 |
|
|
| 資訊管理學系 | 1998 |
|
2000 |
|
|
| 數位金融科技學系 | 2023 |
|
|
|
|
| 管理研究所 |
|
|
|
2003 | |
| 商管專業學院 |
|
2006 |
|
||
| 國際健康管理學位學程 | 2019 |
|
|
|
|
| 智慧醫療創新碩士學位學程 |
|
|
2017 |
|
|
| 資產管理研究所 |
|
|
2025 |
|
|
|
智慧運算學院 |
人工智慧學系 | 2023 |
|
2022 |
|
| 人工智慧學士學位學程 |
2020 (已停招) |
|
|
|
|
| 健康數據科學研究所 |
|
|
2025 |
|